The possible origins of 2019-nCoV

以前に「COVID 19 発生源は武漢疾病予防管理センターなのか？」という記事を書きましたが、
http://morph.way-nifty.com/grey/2020/02/post-f079d5.html

このもともとのソースとなる英文報告は削除されました。しかしそのコピペを残しておいた人がいるらしく、原文がアップされていたので下記します。
https://headlines.yahoo.co.jp/article?a=20200325-00071310-gendaibiz-cn&p=3

この報告はかなりありそうな話です。動物園の飼育係ですら動物にかまれることはあるので、飼育の専門家ではない研究者が実験動物にかまれるのはあり得る話です。数年前には日本でも順天堂大学で学生が赤痢菌を飲み込んでしまうという事故が起こっていますし、ごく最近にも成田空港の検疫室でウィルス遺伝子をぶちまけるというような事故も起こっています。そのようなことがおこったのか、またはウィルスを実験中に吸い込んでしまう（例えば防護服が破れていることに気がつかないとか）というようなこともある得る話です。著者も述べていますが、もう一つの問題は、実験室を掃除したときの紙や雑巾をどのように廃棄したかということもあります。

↓（韓国　中央日報）

中国だけで１６６０人以上の死亡者を出した新型コロナウイルス感染症（コロナ１９）が中国実験室から流出した可能性を提起した論文を中国の学者が発表していた。

１６日、明報や蘋果日報など香港メディアによると、中国広東省広州の華南理工大学生物科学与工程学院(School of biology and Biological Engineering)の肖波涛（Botao Xiao）教授は２０２０年２月６日にグローバル学術サイト「ＲｅｓｅａｒｃｈＧａｔｅ（リサーチゲート）に論文を発表した。論文は新型コロナがコウモリから中間宿主を経て人に伝染した可能性よりも、湖北省武漢の実験室２カ所から流出した可能性を提起した。肖教授は武漢ウイルス研究所よりも武漢疾病予防管理センターが震源地である可能性が高いとみられると主張した。武漢ウイルス研究所は新型コロナが集中的に検出された華南水産市場から１２キロメートル程度離れているのに対し、武漢疾病対策予防管理センターはわずか２８０メートルの距離にあるためだ。

肖教授は実験室からの流出とみている理由について、新型コロナの天然宿主である「キクガシラコウモリ」は武漢から９００キロメートル離れた雲南省・浙江省などに棲息していて、食用としては特に使われていない点を挙げた。また、武漢市政府の報告書や武漢市民の証言を総合すると、華南水産市場でこのようなコウモリは扱われていなかったという。

反面、武漢疾病予防管理センターは２０１７年と２０１９年、実験用に多くのコウモリを捕まえた。２０１７年には湖北省・浙江省などで約６００匹のコウモリを捕まえたが、この中には重症急性呼吸器症候群（ＳＡＲＳ）ウイルスを持つキクガシラコウモリも含まれていた。当時、同センターの研究員は、勤務中にコウモリに噛まれたり尿をかけられたりしたと話した。同センターはコウモリの細胞組織を分離させてＤＮＡとＲＮＡ配列などの研究を行ったが、ここで出た汚染されたゴミがウイルスの温床になったというのが肖教授の主張だ。

初期に新型コロナに感染した患者が訪れた場所として知られている協和がん病院はセンターとは通り一つを挟んだところにあったと論文は伝えた。こうした中、科学技術部の呉遠彬局長は１５日、「実験室でウイルスを研究する際に安全にさらに注意を傾ける内容の指導意見を発表した」と明らかにした。現在、肖教授とは連絡が取れず、該当論文はサイトから削除された状態だ。

↓リサーチゲートに投稿された報告

The possible origins of 2019-nCoV coronavirus (Botao Xiao and Lei Xiao)

The 2019-nCoV coronavirus has caused an epidemic of 28,060 laboratory-confirmed infections in human including 564 deaths in China by February 6, 2020. Two descriptions of the virus published on Nature this week indicated that the genome sequences from patients were 96％ or 89％ identical to the Bat CoV ZC45 coronavirus originally found in Rhinolophus affinis. It was critical to study where the pathogen came from and how it passed onto human.

An article published on The Lancet reported that 41 people in Wuhan were found to have the acute respiratory syndrome and 27 of them had contact with Huanan Seafood Market. The 2019-nCoV was found in 33 out of 585 samples collected in the market after the outbreak. The market was suspicious to be the origin of the epidemic, and was shut down according to the rule of quarantine the source during an epidemic.

The bats carrying CoV ZC45 were originally found in Yunnan or Zhejiang province, both of which were more than 900 kilometers away from the seafood market. Bats were normally found to live in caves and trees. But the seafood market is in a densely-populated district of Wuhan, a metropolitan of ~15 million people. The probability was very low for the bats to fly to the market. According to municipal reports and the testimonies of 31 residents and 28 visitors, the bat was never a food source in the city, and no bat was traded in the market. There was possible natural recombination or intermediate host of the coronavirus, yet little proof has been reported.

Was there any other possible pathway？　We screened the area around the seafood market and identified two laboratories conducting research on bat coronavirus. Within ~280 meters from the market, there was the Wuhan Center for Disease Control Prevention (WHCDC). WHCDC hosted animals in laboratories for research purpose, one of which was specialized in pathogens collection and identification. In one of their studies, 155 bats including Rhinolophus affinis were captured in Hubei province, and other 450 bats were captured in Zhejiang province. The expert in collection was noted in the Author Contributions. Moreover, he was broadcasted for collecting viruses on nation-wide newspapers and websites in 2017 and 2019. He described that he was once by attacked by bats and the blood of a bat shot on his skin. He knew the extreme danger of the infection so he quarantined himself for 14 days. In another accident, he quarantined himself again because bats peed on him. He was once thrilled for capturing a bat carrying a live tick.

Surgery was performed on the caged animals and the tissue samples were collected for DNA and RNA extraction and sequencing. The tissue samples and contaminated trashes were source of pathogens. They were only ~280 meters from the seafood market. The WHCDC was also adjacent to the Union Hospital where the first group of doctors were infected during this epidemic. It is plausible that the virus leaked around and some of them contaminated the initial patients in this epidemic, though solid proofs are needed in future study.

The second laboratory was ~12 kilometers from the seafood market and belonged to Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences. This laboratory reported that the Chinese horseshoe bats were natural reservoirs for the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) which caused the 2002-3 pandemic. The principle investigator participated in a project which generated a chimeric virus using the SARS-CoV reverse genetics system, and reported the potential for human emergence. A direct speculation was that SARS-CoV or its derivative might leak from the laboratory.

In summary, somebody was entangled with the evolution of 2019-nCoV coronavirus. In addition to origins of natural recombination and intermediate host, the killer coronavirus probably originated from a laboratory in Wuhan. Safety level may need to be reinforced in high risk biohazardous laboratories. Regulations may be taken to relocate these laboratories far away from city center and other densely populated places.